1.不同的培养目标和方向
在本科水平上，专业硕士与普通硕士相同，但培养目标明显不同。
其突出特点是学者型与职业型紧密结合，重视实践和应用，重视技术人才培养，一般硕士学位以学科设置、学术研究为主，重视理论研究，重视理论人才培养。
专业硕士课程的教学内容强调理论与应用课程的有机结合，强调案例分析与实践研究，一般硕士研究生重视加强基础理论学习，重视培养学生从事科研创新的能力和素质。
二是入学专业不同
硕士和招生专业很多，只有财务、应用统计、税务、国际商务等40个专业。
普通硕士专业包括哲学、经济、法学、教育学、文字学等13个学科，其次是一级、二级学科，复盖各专业的方向。
三、不同的调剂要求
硕士学位的考试科目通常可以覆盖硕士研究生的初试科目或难度范围，因此，调整通常是从普通硕士学位转移到专业硕士学位，而专业硕士学位不能转移到普通硕士学位。
四、学制不同
普通硕士学位制度为2-3年，普通硕士学位制度为3年。具体情况以当年招生单位政策为准。
五、教师制度不同
硕士生实行双导师制，在培训过程中，校内教师主要教授理论知识和学术指导，校外教师主要注重技术培训和实践指导。
普通硕士生实行单一教师制，主要指导学生理论学习和论文完成。
6.学位论文不同
研究生论文主要是加强应用指导，如研究报告、规划设计、产品开发、案例分析等具有较高实用价值的论文，与普通硕士研究生相比，它们更传统，主要是科研和学术论文。
